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而目前一个较为突出的问题是，一些地区输电规划仍滞后于电源规划。
王民浩称，比如我国金沙江干流的许多西电东送工程，白鹤滩、梨园、阿海等工程，目前是送电南方电网的广东、广西等地区，还是送电华中或者华东地区就存在很大争议，需要在“十二五”期间结合这些工程实施情况研究协调与明确。
此外，“十一五”水电规划装机目标虽然已超额实现，但开工目标仅实现27.1%，所以“十一五”末和“十二五”初加快核准大型水电项目是实现 “十二五”和2020年水电发展目标的关键。
除水电外，风电产业规划也在大步跃进，但同样面临输电难题。
从2003年以来，我国风电装机容量年均增长率达到70％以上。到2009年底，全国风电建设总容量为2268万千瓦，已并网运行容量为1767万千瓦，总吊装容量达到2412万千瓦。我国风电装机容量世界排名由2008年的第四名升至第三名。
“目前对于风电的最新发展目标已基本明确，2015年全国风电规划装机9000万千瓦，其中海上风电500万千瓦，到2020年全国风电规划装机1.5亿千瓦，其中含海上风电3000万千瓦。”上述参与规划的专家称，“未来出台的规划将强调电网输配能力与风电发展规划协调发展，在建设风电电源时，必须考虑电网配套建设。”
争议太阳能
2004年以来，在国际光伏市场的强大需求拉动下，我国光伏产业发展迅速，到2009年太阳电池年产量到达4000MWp，约占全球产量的43%，成为全球最大的太阳能电池生产国家。然而，与之相对应的是，我国在太阳能应用领域却发展缓慢。
“对于太阳能产业的发展和定位，是目前参与指定规划的专家讨论比较多的环节。”上述参与规划的专家对记者说，有些专家认为，太阳能产业成本过高，而且其原料多晶硅存在环境污染等问题，不适合大规模发展，而也有专家认为，太阳能等尚在发展早期，应大力支持其快速发展。
根据《新兴能源产业发展规划》，我国初步规划到2015年，太阳能发电装机达到500万千瓦，到2020年，太阳能发电装机达到2000万千瓦。
曾少军表示，虽然我国光伏产业已经连续多年位居世界产量首位，但国内光伏应用市场依然严重滞后。尤其国内光伏并网发电中标电价过低的问题，严重困扰了企业的发展。他建议，对于光伏发电这种新兴产业，国家应该设立标杆电价、补贴电价，而非采用市场化竞争的“招标定价”方式，以促进其发展。
“针对太阳能行业在国内的应用，目前给它的定位是按照‘统筹规划、稳步发展’的原则，有针对性的予以发展。”上述参与规划的专家说，比如在太阳能资源丰富、具有荒漠和闲置土地资源的地区，建设一批集中并网的光伏发电；在偏远、无电地区推广户用光伏发电系统或建设小型光伏电站，为大约200万户边远地区农牧民提供基本生活用电；同时在城镇推广与建筑结合的分布式并网光伏发电系统。
